島嶼掃描是首次出現於《太陽／月亮》ＱＲ掃描中的一項功能。島嶼掃描可以調查玩家所在的島嶼，找出原本未棲息在阿羅拉的寶可夢。每讀取一次QR Code，玩家會獲得10點或20點的點數。當集齊100點，就可以使用一次島嶼掃描。出現蹤影的寶可夢會依據星期和玩家所處的島嶼的改變而不同。使用島嶼掃描後，玩家將在1小時內於寶可夢蹤影出現的地點遇到寶可夢，如果玩家將寶可夢擊倒或在1小時內沒有收服它，它將失去蹤影。
島嶼掃描到的寶可夢全部都不屬於遊戲本身的阿羅拉圖鑑。但是如果收服的話，也會被記錄為已擁有過，再次遭遇到這種寶可夢的時候也會有“已擁有過”的標記出現。這個方法得到的寶可夢大部分會具有必須通過遺傳才能學到的蛋招式。
一般掃碼次數上限10次，每2小時恢復一次使用機會，掃滿10次可以開啟一次島嶼掃描的機會。
以下是小編找到的特殊QR碼，掃一次有兩倍的功效，所以每天掃5次就可以了（每天可反覆使用）
| 島 | 日期 | 等級 | 等級 | 招式 | 出現地點 | |||
| 美樂美樂島 | 周日 | 小火龍 | 12 | 雙倍奉還 | 煙幕 | 火花 | 抓 | ３號道路 |
| 周一 | 傑尼龜 | 12 | 水流噴射 | 縮入殼中 | 水槍 | 撞擊 | 通海洞穴 | |
| 周二 | 大岩蛇 | 14 | 耕地 | 憤怒 | 岩石封鎖 | 落石 | 十克拉山丘 | |
| 周三 | 墨海馬 | 18 | 水之波動 | 龍捲風 | 水槍 | 瞪眼 | 卡拉蔚灣 | |
| 周四 | 粉蝶蟲 | 9 | 憤怒粉 | 吐絲 | 麻痹粉 | 撞擊 | 好奧樂市 | |
| 周五 | 妙蛙種子 | 10 | 青草場地 | 藤鞭 | 叫聲 | 撞擊 | ２號道路 | |
| 周六 | 燭光靈 | 9 | 挺住 | 火花 | 火焰旋渦 | 濁霧 | 好奧樂墓園 | |
| 阿卡拉島 | 周日 | 拉魯拉絲 | 17 | 薄霧場地 | 魔法葉 | 幸運咒語 | 魅惑之聲 | ６號道路 |
| 周一 | 海豹球 | 19 | 腹鼓 | 鹽水 | 冰球 | 再來一次 | ７號道路 | |
| 周二 | 力壯雞 | 20 | 踢倒 | 蓄能焰襲 | 啄 | 潑沙 | ８號道路 | |
| 周三 | 獨劍鞘 | 24 | 廣域防守 | 燕返 | 影子偷襲 | 身體輕量化 | 阿卡拉島郊外 | |
| 周四 | 大針蜂 | 14 | 憤怒 | 亂擊 | 雙針 | ４號道路 | ||
| 周五 | 森林蜥蜴 | 16 | 青草場地 | 超級吸取 | 電光一閃 | 吸取 | ５號道路 | |
| 周六 | 沼躍魚 | 17 | 雙倍奉還 | 識破 | 擲泥 | 水槍 | 潺潺之丘 | |
| 烏拉烏拉島 | 周日 | 獨角犀牛 | 32 | 防守平分 | 岩石爆擊 | 逐步擊破 | 重踏 | 火特力山 |
| 周一 | 小山豬 | 33 | 冰錐 | 猛撞 | 冰礫 | 冰凍之風 | 卡璞村 | |
| 周二 | 波皇子 | 35 | 囂張 | 鹽水 | 亂擊 | 忍耐 | １６號道路 | |
| 周三 | 樹林龜 | 36 | 重磅衝撞 | 寄生種子 | 超級吸取 | 咬住 | 烏拉烏拉花園 | |
| 周四 | 大比鳥 | 29 | 鋼翼 | 羽毛舞 | 龍捲風 | 電光一閃 | １０號道路 | |
| 周五 | 猛火猴 | 29 | 增強拳 | 火焰輪 | 亂抓 | 無理取鬧 | １１號道路 | |
| 周六 | 牙牙 | 30 | 雙倍奉還 | 龍爪 | 點到為止 | 劈開 | 輝克拉尼山 | |
| 波尼島 | 周日 | 麻麻鰻魚王 | 55 | 咬碎 | 放電 | 頭錘 | 撕裂爪 | 波尼樹林 |
| 周一 | 波士可多拉 | 57 | 起死回生 | 重磅衝撞 | 捨身衝撞 | 鐵壁 | 波尼曠野 | |
| 周二 | 洛托姆 | 61 | 充電 | 禍不單行 | 電球 | 替身 | 波尼險路 | |
| 周三 | 保姆蟲 | 57 | 青草場地 | 飛葉風暴 | 劍舞 | 找夥伴 | 波尼花園 | |
| 周四 | 布里卡隆 | 45 | 撒菱 | 泥巴射擊 | 種子炸彈 | 尖刺防守 | 椰蛋樹島 | |
| 周五 | 甲賀忍蛙 | 44 | 傳遞禮物 | 替身 | 出奇一擊 | 飛水手裏劍 | 波尼原野 | |
| 周六 | 妖火紅狐 | 44 | 祈願 | 精神衝擊 | 光牆 | 魔法火焰 | 波尼古道 | |
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